Родился 9 января 1951 года в Верхней Пышме. Трудовую деятельность начал в 15 лет слесарем жилищно-коммунального отдела Пышминского медеэлектролитного завода (ныне АО «Уралэлектромедь).

Без отрыва от работы в 1971 году закончил Свердловский горно-металлургический техникум имени Ползунова и получил специальность техника – механика по оборудованию цветной металлургии.

После окончания техникума В.Д. Щербатюк поступил слесарем – ремонтником на ремонтно-строительный эксплуатационный участок треста «Уралцветметремонт, на который вернулся уже исполняющим обязанности мастера после службы в Армии.

10 лет он занимался ремонтом оборудования на Пышминском медеэлектролитном заводе, а затем на комбинате «Уралэлектромедь».

В 1985 году В.Д. Щербатюк перешел разливщиком металла в медеплавильный цех комбината. В 1994 году назначен начальником участка по переработке отходов меди медеплавильного цеха.

Вскоре на базе участка был создан цех подготовки шихты, и В.Д. Щербатюку доверили возглавить новое подразделение.

Затем на протяжении пяти лет он занимался строительством и эксплуатаций металлургического комплекса по производству черновой меди медеплавильного цеха. Благодаря своим организаторским способностям В.Д. Щербатюк сумел в сжатые сроки наладить подготовку больших объемов поступающего вторсырья для переплавки.

Как начальник цеха приемки и переработки сырья В.Д. Щербатюк многое сделал для того, чтобы оснастить цех современными производственными прессами , погрузчиками , кранами, максимально механизировать труд рабочих.

Приказом-постановлением комитета Российской Федерации по металлургии и Центрального Совета горно-металлургического профсоюза России от 18 июня 1996 года В.Д. Щербатюку присвоено звание «Почетный металлург».

Зная специфику медеэлектролитного производства, он активно участвовал в рационализаторском движении. За научно-технические разработки награжден премией имени Б.А.Кривоусова.

Указом Президента Российской Федерации №940 от 19июля 2004 года В.Д. Щербатюку присвоено звание «Заслуженный металлург Российской Федерации».

В.Д. Щербатюк награжден памятной медалью ОАО «Уралэлектромедь» «За выдающиеся заслуги».

В.Д. Щербатюк принимал активное участие в общественной жизни, много лет являлся членом Совета трудового коллектива предприятия, был делегатом I съезда профсоюза металлургов России.

Умер 23 июля 2014 года, похоронен на Верхнепышминском кладбище.